Jūras ērgļu skaits pēdējās desmitgadēs arī Latvijā ir ievērojami pieaudzis, visvairāk tie sastopams tieši Kurzemē. Parasti šie ērgļi ligzdo ūdenstilpju tuvumā, jo tie pārtiek no zivīm un ūdensputniem. Līdz ar skaita palielināšanos, tie apgūst arvien jaunas teritorijas un biežāk sāk ligzdot attālināti no ūdeņiem. Viena no sugas īpatnībām ir ligzdošana izcirtumos, kur tie iecienījuši ekoloģiskos kokus – šādās vietās Latvijā ligzdo vairāk nekā viena trešā daļa no visiem jūras ērgļiem. Jūras ērgļi ir ziemotāji – tie uzturas ligzdošanas rajonā visu gadu.